Peut-être est-ce une question de température de fonctionnement? Les refroidis direct fonctionnent à une température nettement plus basse donc auraient (peut-être) un rendement inférieur... Supposition seulement.

 Nandi a raison.
Un moteur à refroidissement direct par eau de mer (ou douce) travaille a une très basse température même s'il y a un calorstat car il ne faut pas que l'eau de mer soit trop chaude tout simplement pour des raisons de précipitation du sel dans les circuits et donc de gros risques de bouchage des canalisations.
Avec un moteur marinisé ou à échangeur, le moteur travaillera à une température plus haute, constante et régulée indépendamment du régime moteur et de la charge. Le débit est constant pour refroidir l'échappement, mais régulé en interne par le calorstat.
Il y a aussi le fait de passer d'un vieux moteur à un moteur très récent, voir moderne, la perte de CV apparents est compensée par la modernité.
Par contre, je ne suis pas sûr que le couple, beaucoup plus primordial sur un bateau soit plus important ou égal...
A vérifier.
Je privilégie le couple à la puissance affichée, souvent à très haut régime (pour moi).