le B+ de l'alternateur va sur l'entrèe du répartiteur, les sorties vont sur la batterie moteur et sur la batterie service. SIMPLE.
Comme l'alternateur débite beaucoup, si 60A il faut du 10mm2 minimum.
Depuis le + de la batterie moteur il y a normalement un gros fil rouge env 25mm2  qui passe par un coupe circuit et qui va dirrectement sur le démarreur (généralement  sans fusible comme sur les autos)
Depuis le + de la batterie service il y a un gros fil qui va sur un coupe-circuit qui alimente les différents fusibles.
Normalement il n'y a pas d'autres fils sur le + des batteries; sauf éventuellement sur la service: alimentation de mémoires (radio) lampe pour l'entrée du bateau ou aussi panneaux solaires, éolienne etc. Si des petits fils partent des + batteries il faut impérativement leur mettre un fusible à ras les batteries.
Normalement pour les panneaux solaires ou l'éolienne on met des répartiteurs dédiés.

Si le répartiteur  est "simple" il y aura une chute de tension d'env. 0,7 volts qu'il faudra compenser si le régulateur le permet ou alors avec une astuce assez simple. Quel modèle de régulateur ?  certains régulateur bosch ont une boucle que l'on coupe pour faire les 0,7 v de plus.

la solution du régulateur dit sans pertes (0,1volt)aurait été préférable

Roger