Pour s'arrêter à Pantelleria, il n'y a que le port et éventuellement le micro mouillage de la côte ouest mais gare à la houle. Je n'ai rien vu d'autre lorsque j'en ai fait le tour.
On entre dans le port et on se met là où il y a de la place comme indiqué dans le Imray. Il existe aussi une petite marina qui a son accès dans l'entrée du port et là encore, il faut tenter sa chance.  Comme en général on vit à bord, si problème, on change de place.
Néanmoins, ces informations ont été "vécues" il y a  3 ans. Il y a peut être eu des changements. Par contre, une fois amarré au port, ça vaut vraiment le coup de visiter l'intérieur de l'île en louant une voiture ou un  scooter. Autant l'île est assez lugubre et inhospitalière par mer, autant elle est chaleureuse par terre. A ne pas louper : le vin  local très particulier et unique en son genre. Une célèbre artiste Française, qui y vit, est aussi productrice de vin de Pantelleria et elle en est très fière.

on a eu un échange sur  le forum il n'y a pas longtemps sur Pantelleria, voir lien ci-dessous

http://www.stw.fr/forumstw/quest_answers.cfm?quest_id=28467&topic_id=22&critere=canal de sicile&st_row=1&ans_quest=ans&s_st_row=1&sqlfilter=%20and%20quest%5Ftopic%5Fid%20%3D%2022%20and%20quest%5Ftext%

Attention en entrant au port, il ne faut pas se diriger vers la partie droite, car il y a peu de fond et les petits bateaux des pêcheurs s'y trouvent.
Par contre, on peut se mettre à "long side" dans la partie gauche et sans problème (du moins pour une courte durée).
A la sortie du port, j'ai doublé une tortue (caouane) qui prenait la même direction que nous (Sicile).
Bonne navigation

pantelléria ,on s'y arrête au retour de Tunisie .Vraiment ,installations portuaires déplorables :le bout de quai présentait des ferrailles et autres poutres de bois agressives,le grand quai pour cargos ou autre ferries ,inutilisé ,inconfortable sinon dangereux pour le bateau par vent du Nord et par les vagues des bateaux qui entrent ou sortent .Seul moment paisible ,en mouillant dans la première darse ,en entrant ,à droite,sans vent quart nw.Je n'y retournerai pas .A bon entendeur.Qd à la description de l'Imray ,là encore elle me parait légèrement fallacieuse .On se demande s'il y est allé .

au sud de l'ile il y a un superbe petit port avec 1 restaurant ( terrasse sur la mer).
en entrant tout de suite à gauche il y a un quai pour 2 ou 3 bateaux avec plus de 4 mètres d'eau pas de roche contre le quai.

j'ai retrouvé son nom : scari's harbourg

je suis passé cinq fois à Pantalleria, en mai de cette année pour la dernière fois : c'est tout ou rien, certains passent vite, moi j'aime cette ile un peu particulière.Volcan dans la mer, culminant à plus de 800 m,cote tourmentée et noire de lave, pas de plage, très hautes falaises au sud,quelques mouillages de beau temps au nord-est, deux ports très surs, un tout petit, Scauri sur la cote ouest et le port principal au nord, tous gratuits.
A Scauri, de la place sauf haute saison,plus de 3 m d'eau contre le quai de de la jetée, ravitaillement au village à un quart d'heure à pieds, pas d'eau ni d'électricité;mouillage devant le port si beau temps.A la capitale,vieux port à babord en entrant , très incomfortable voire intenable par fort vent de nord ouest, ancre tenant mal (gros galets ronds de lave) et arrière à quai; nouveau port à tribord en allant tout à fait au fond contre le quai : beaucoup d'eau (3m ou plus),pas d'électricité et eau ou gas oil uniquement par petite citerne sur demande.On peut se retrouver à couple de 4 à 5 gros chalutiers si le temps dans le canal de sicile se gate vraiement (nord ouest) : on se retouve en 10 mn au milieu du port, ils s'occupent des manoeuvres et en prime vous offrent du poisson!! Une visite sympa de l'ile peut se faire en louant scooter ou voiture : faire le tour et monter au sommet sans oublier de passer au lac cote nord est; vignes, oliviers, pins dans les hauts, nature sauvage partout ...et peut-être Carole Bouquet dans ses vignes!!!.
Internet (...très cher !!) sur le port à coté des bars, supermercatos derrière, liaisons aériennes ou par ferry avec Trapani; à titre indicatif le chantier du port aurait pu me garder le bateau à sec pour 9 mois tout compris pour 1200 euros environ (35 pieds) ...mais j'ai continué jusqu'à Prévéza